Participants on an
IPGRI-sponsored training course in Latin America. © David Williams, IPGRI
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Conservation et Utilisation des Ressources Phytogénétiques
(RPG)
Version 2.1
1. Introduction
1.1 Biodiversité
 définition et
utilité
1.2 Origine de l'agriculture, domestication, centres d'origine
et de diversité des plantes cultivées
1.3 Principes de génétique
1.4 Diversité génétique et concept de pool
de gènes
>
1.5 Erosion génétique
1.6 Besoin de stratégies de conservation complémentaires
1.7 Population locale et conservation
1.8 Programmes nationaux de conservation des RPG
(structure, organisation, système de réseaux)
1.9 Programmes régionaux et internationaux (systèmes
multilatéraux)
1.10 Réseaux centrés sur une culture
1.11 Sensibilisation du public
2. Sujets à caractère mondial et politique
2.1 Histoire de l'avènement des RPG
2.2 La Commission de la FAO sur les RPG
2.3 Les collections du GCRAI
2.4 Les droits de propriété intellectuelle
2.5 Accès au germoplasme
>
2.6 Activités de base
>
2.7 La CNUED et la convention sur la biodiversité
>
2.8 Questions de biotechnologies
>
2.9 Privatisation de la recherche agricole et ses conséquences
sur la conservation des RPG
3. Information
3.1 Sources d'information sur les RPG
3.1.1 Travaux de référence
3.1.2 Littérature primaire - journaux
3.1.3 Sources secondaires - Résumés d'articles,
bases de données, "WWW".
>
3.1.4 Comment être à jour
3.1.5 Comment obtenir la litérature (moins cher)
3.2 Organismes intervenant sur les RPG
(FAO, IPGRI et les autres centres du GCRAI etc...)
4. Documentation
4.1 Concepts généraux
· Standards, codes
· Précision
>
· Média
· Echange
>
4.2 Conception de systèmes de documentation
>
(bases de données écogéographiques)
5. Enquête sur la diversité végétale
pour la conservation
5.1 Diversité génétique des RPG
5.1.1 Origines de l'agriculture, domestication
5.1.2 Variabilité génétique
(Comment les système génétiques et les mutations
affectent les variations observées entre les populations
et au sein des populations)
5.1.2.1 Systèmes génétiques
5.1.2.1.1 Système de reproduction
5.1.2.1.2 Mode de pollinisation
5.1.2.2 Mutation de gène, recombinaison, selection, dérive
génétique
(Comment la variation génétique apparaît)
5.1.2.3 Le concept de pool de gènes
5.1.3 Distribution de la diversité génétique
5.1.3.1 Centre d'origine et de diversité des plantes cultivées
5.1.3.2 Effet des facteurs physiques/écologiques/sociaux
5.1.4 Indicateurs de diversité
5.1.4.1 Caractérisation morphologique/ physiologique
5.1.4.2 Caractérisation biochimique/moléculaire
5.1.4.3 Caractérisation et évaluation par le fermier
5.1.5 Evaluer la menace de l'érosion génétique
5.1.5.1 Les causes de l'érosion génétique
5.1.5.2 Quantifier la menace
5.1.5.3 Systèmes de suivi mondiaux
5.2 Enquêtes écogéographiques
5.2.1 Planification
>
5.2.2 Collecte de données écogéographiques
>
(Toute la section sur "l'élaboration de la base de
données écogéographique" à traiter
dans la section sur la documentation. En outre inclure ce qui
suit)
>
5.2.2.1 Etudes préliminaires de terrain
5.2.2.2 Aides à l'identification
5.2.3 Analyse des données écogéographiques
5.2.4 Résultats des enquêtes écogéographiques
5.3 Mettre en place une stratégie de conservation complémentaire
5.3.1 Evaluer le besoin de conservation
5.3.1.1 Erosion génétique
5.3.1.2 Utilisation du germoplasme
5.3.1.3 Combler les vides dans les collections
5.3.1.4 Recherche
>
5.3.2 Options
>
5.3.3 Pour et contre des différentes options
6. Conservation in situ
6.1 Conservation au champ
6.2 Conservation in situ des espèces sauvages
6.3 Contrôler la diversité conservée
6.4 Gestion du matériel génétique conservé
6.5 Gestion des données
>
6.6 Participation locale dans la conservation in situ
7. Conservation ex situ
7.1 Collections ex situ: vue d'ensemble
- Types
- Problèmes de stabilité génétique
- Problèmes de gestion générale
7.2 Conservation de graines
7.2.1 Principes de stockage des graines
(graine orthodoxe ou graine récalcitrante; contrôle
des graines, traitement des graines y compris séchage,
nettoyage et conditionnement)
7.2.2 Normes pour différents types de banques de gènes
7.2.3 Organisation de banques de gènes
7.2.4 Stabilité génétique
7.2.5 Gestion des collections
7.3 Banques de gènes au champ
7.3.1 Principes généraux (modèle, répétition
etc...)
>
7.3.2 Gestion durable
7.3.3 Plantes à racines et tubercules
7.3.4 Espèces ligneuses (y compris cocotier)
7.3.5 Arboreta et jardins botaniques
7.4 Conservation in vitro
7.4.1 Principes généraux
7.4.2 Culture de tissus (croissance ralentie)
7.4.3 Cryoconservation
>
7.4.4 Stabilité génétique
>
7.4.5 Gestion de la collection
>
7.5 Conservation d'autres matériels
7.5.1 Pollen/ovules
7.5.2 ADN
>
7.6 Gestion des données
8. Collecte
8.1 Information de base/Théorie
8.1.1 Introduction à la collecte
8.1.1.1 Raisons de la collecte
8.1.1.1.1 Collecte de "sauvetage"
8.1.1.1.2 Collecte pour utilisation immédiate
8.1.1.1.3 Collecte en zone non encore prospectée
8.1.1.1.4 Collecte pour la recherche
8.1.1.1.5 Collecte d'occasion
8.1.1.2 Types de mission de collecte
8.1.1.2.1 Plusieurs espèces ou une seule espèce
8.1.1.2.2 Collecte d'espèces sauvages ou d'espèces
cultivées
8.1.1.2.3 Visite unique ou plusieurs visites
8.1.1.3 Collecte centralisée ou décentralisée
8.1.1.4 Dangers liés à la collecte
8.1.1.5 Ingrédients pour une mission réussie
8.1.2 Aspects juridiques et Code de Conduite de la FAO
8.1.2.1 Droits des sélectionneurs de plantes
8.1.2.2 Droits de brevets
8.1.2.3 Système Mondial de la FAO
8.1.2.4 CNUED
>
8.1.2.5 Code de Conduite de la FAO
>
8.1.2.6 Autres législations
8.1.3 Approche participative propre à la collecte
(inclure la connaissance traditionnelle)
8.1.4 Stratégies d'échantillonnage
8.1.4.1 Théorie et pratique
8.1.4.2 Stratégies pour les espèces sauvages
8.2 Aspects pratiques
8.2.1 Planification des missions de collecte
8.2.1.1 Autorisations et dispositions légales
8.2.1.2 L'équipe de collecte
8.2.1.3 Transport
>
8.2.1.4 Itinéraire
>
8.2.1.5 Durée
8.2.1.6 Equipement
>
8.2.1.7 Le plan de collecte
>
8.2.2 Collecte de données sur le terrain
>
8.2.3 Manipulation du matériel sur le terrain
>
8.2.3.1 Graines
8.2.3.2 Matériel végétatif
8.2.3.2.1 Racines et tubercules
8.2.3.2.2 Graminées et légumineuses
8.2.3.2.3 Culture in vitro
8.2.3.3 Pollen
>
8.2.3.4 Micro-organismes
>
8.2.3.5 Herbier
8.2.4 Traitement du matériel collecté
8.2.5 Rédaction des rapports de collecte
9. Régénération d'échantillon
9.1 Théorie : principes génétiques de la
régénération
9.2 Pratique : méthodes, fréquences, nombres, sites
9.3 Normes/directives
>
9.4 Régénération par les fermiers
>
9.5 Gestion des données
10. Caractérisation et évaluation
10.1 Mesure de la variation génétique
(inclure liste de descripteurs)
10.1.1 Caractères morphologiques/physiologiques
10.1.2 Caractères cytologiques
10.1.3 Marqueurs biochimiques (isozymes)
10.1.4 Méthodes moléculaires (RAPDs, RFLPs, CSRs,AFLPs, etc.)
10.1.5 Caractérisation et évaluation par les fermiers
10.2 Analyse des données
(introduction aux statistiques de génétique, indices
de diversité)
10.3 Gestion des données
10.3.1 Conception et développement de base de données
10.3.2 Publication des résultats, catalogues
11. Utilisation du germoplasme
11.1 Types d'utilisation et utilisateurs (importance de la durabilité)
11.1.1 Recherche
>
11.1.2 Introduction de plantes
>
11.1.3 Sélection (directe)
>
11.1.4 Amélioration
11.1.5 Sélection (différents types y compris sélection
décentralisée)
11.1.6 Utilisation par la population locale
(ethnobotanique, foresterie communautaire, sélection par
le fermier, remise en état etc..)
11.2 Les contraintes à l'utilisation et leurs solutions
11.2.1 Information sur les collections
11.2.2 Collections "noyaux" ("core collections")
11.2.3 Aspects sanitaires
11.2.4 Taille des obtentions
11.2.5 Restrictions politiques sur l'accès et les échanges
12. Etat sanitaire du germoplasme et son échange sans danger
12.1 Echange du germoplasme
12.2 Directives pour les échanges
12.3 Services de quarantaine
12.4 Dépistage des maladies et ravageurs
13. Foresterie
13.1 Diversité génétique
13.1.1 Ampleur et distribution
13.1.2 Variation génétique
13.1.3 Erosion génétique
13.2 Conservation et gestion
13.3 Utilisation et amélioration
13.4 Les ressources forestières et l'environnement
13.5 Impératifs/coopération d'ordre mondial
14. Etudes de cas
(comment les dichotomies ci-dessous affectent les différents
aspects de la conservation à partir de la collecte)
14.1 Espèces sauvages contre espèces cultivées
14.2 Graine contre matériel végétatif
14.3 Orthodoxe contre récalcitrant
14.4 Allogamie contre autogamie
14.5 Annuel contre pérenne
14.6 Ressources (humaines, physiques) disponibles
14.7 Considérations climatiques
14.8 Types d'organisation de programme de RG
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